宏基因组绝对定量

真实还原菌群的组成及绝对含量

宏基因组绝对定量服务简介

为弥补传统方法缺陷、实现微生物组全面精准高效检测,基于 spike-in DNA 内参序列的宏基因组绝对定量测序(QMP)技术被开发,其核心是向样本 DNA 中加入不同梯度已知拷贝数的内标序列,再与样本 DNA 一同构建宏基因组文库并开展高通量测序,彻底解决传统相对丰度测序“只知比例、不知真实数量”的核心痛点。

仅依赖相对丰度数据会 “掩盖群落动态”:例如某细菌相对丰度升高,可能是自身增殖(真实繁荣),也可能是其他物种消亡(虚假繁荣)。这一缺陷会直接影响对微生物互作、环境胁迫等驱动因素的判断,凸显 “绝对丰度量化” 的必要性。

技术优势

数据真实

直接输出绝对数量,样本间差异可直接对比,结论更可靠;

数据多用

一次测序完成物种鉴定+绝对定量,无需额外实验;

覆盖全面

低丰度、稀有微生物也能精准捕捉,无遗漏关键信息

技术路线

送样指导

样品类型 送样要求 保存及运输
普通土壤 除去土壤表层未分解的凋落物层、动植物残体、石砾等杂质,将大块的样品捣碎,过2mm筛后,分装至2mL或更大体积的EP管或冻存管中;每管土壤含量大概0.25~0.5g,需保证送样量在1~2g。 样本-80℃或液氮中长期保存,干冰运输
根际土壤 收集植物植株,去除根部大块土壤;摇动植株去除附着不紧密的土壤,使用无菌刷子收集根部附着紧密的土壤;随机多点取样5-10g,过2mm筛后,分装至2mL或更大体积的EP管或冻存管中;每管土壤含量大概0.25~0.5g,需保证送样量在1~2g。
粪便 无菌牙签或粪便取样器截取样品中段内部(避免表层中的肠道膜脱落细胞),外部容易污染且细菌DNA由于接触空气可能有降解。将已取的粪便样品分装至2mL EP管(无菌)或冻存管(无菌)中,每管粪便量为0.5~2g,每个样品分装2~3管备份。
肠道内容物 在实验对象死亡后,无菌条件下,取出整个肠道,用无菌解剖刀切取所需肠段的,用无菌手术刀挖取内容物分装至2mL EP管(无菌)或冻存管(无菌)中,每管组织量为0.5~2g,每个样品分装2~3管备份
水体 过滤大量低微生物含量的清亮水样用0.22μm 的聚苯醚砜滤膜,每个样本至少1L水样。浑浊水样使用0.22μm滤膜过滤缓慢容易堵塞时,建议使用0.45μm的混合纤维素酯滤膜,每个样本0.5L-1L水样;如果水样中不可溶解的颗粒较多,需要使用2-5μm孔径的滤膜将不可溶解的颗粒杂质滤去,再使用0.22μm或0.45μm的滤膜富集菌体,每个样本0.5L-1L水样。

案例文章

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